8月31日，国内首款具有完全自主知识产权的高精度番茄育种固相基因芯片在北京城市副中心正式发布，标志着我国番茄育种核心工具长期依赖进口的“卡脖子”局面被打破，番茄种业正式迈入自主可控的“中国芯”时代。
“京番芯1.0”新闻发布会 北京市通州区国际种业科技园区管理委员会供图近5000个核心位点覆盖关键农艺性状
“京番芯1.0”是为番茄分子育种量身打造的产业级芯片，包含近5000个核心位点，位点在番茄染色体上均匀分布，覆盖产量、品质、抗病虫、抗逆等重要农艺性状，可有效识别相关遗传变异。芯片位点类型为SNP，位点总数由5K基础位点、性状位点及转基因元件位点组成，参考基因组为Slycopersicum_SL4.0。
该芯片位点来源于1100余份番茄自交系，涵盖醋栗番茄、樱桃番茄及栽培种等丰富遗传背景。经检测，芯片检出率达99.12%，检测重复性达99.85%，两项核心指标均达到国际先进水平，可显著提高种质资源精准鉴定和育种选择效率，快速筛选优良基因型，加速优质番茄品种研发进程。
全链条自主可控 检测更快更灵活
“京番芯1.0”实现了从扫描仪、芯片、试剂到软件算法的全链条自主知识产权，是我国首个聚焦番茄育种的自主化固相基因芯片技术体系，结束了我国番茄分子育种核心装备与技术体系长期依赖进口的历史。
在检测效率方面，单轮实验可在72小时内完成并直接获得基因型数据，满足规模化产业应用的时效需求；在成本控制方面，同级别位点密度下具有显著成本优势，大幅降低育种企业的技术应用门槛，让更多中小育种企业用得起、用得好。此外，芯片支持灵活升级，使用过程中可根据需求随时增加SNP位点；单个SNP位点采用15个到30个微球重复检测，进一步保障数据准确可靠。
八大应用场景贯通育种全流程
“京番芯1.0”可广泛应用于种质资源精准鉴定、遗传多样性分析、分子标记辅助育种、基因组选择育种、品种身份鉴定与保护、品种转基因成分鉴定、实质性派生品种鉴定、全基因组关联分析与QTL定位等八大场景，实现从基础研究到品种保护、从实验室到田间地头的育种全链条覆盖，为番茄种业提供一站式分子育种解决方案。
“京番芯1.0”由北京通州国际种业科技有限公司、北京市农林科学院蔬菜研究所、山东农业大学生命科学学院、苏州拉索生物芯片科技有限公司等单位协同攻关完成。
依托北京通州国际种业科技园区的分子育种共性技术平台与育种加速器、逆境鉴定平台等专业设施，该芯片将推动科研成果快速对接产业需求，助力番茄种业向精准化、数字化、规模化方向升级。
来源：北京日报客户端